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【2026年4月】Amazon手数料改定の全容と対策|利益を守る防衛戦略

【2026年4月】Amazon販売手数料・FBA料金改定の全容と利益防衛戦略|株式会社IRUNE
📋 この記事のポイント
  • 2026年4月に実施されるAmazon手数料改定は、4月1日の販売手数料引き上げ(例:10%→10.4%)4月15日のFBA長期保管料ペナルティ新設という2段階構成で、出品者の利益構造に直接的な影響を与える。
  • 販売手数料0.4%の引き上げは一見わずかに見えるが、年間売上規模によっては数十万〜数百万円単位のコスト増につながる可能性があり、早急な利益シミュレーションが必要だ。
  • 365日超の在庫に対する「月額20円/点」ペナルティは、滞留在庫を抱えたまま放置している事業者に対して即座に損益を悪化させるルール変更である。
  • 株式会社IRUNEは、元Amazon在籍メンバー多数の知見をもとに、価格改定・梱包最適化・不良在庫の早期処理という3つの防衛戦略で、手数料改定後の利益維持を目指す事業者を支援している。

1. 2026年4月 Amazon手数料改定の全体像

今回の改定は「販売手数料(4/1)」と「FBA長期保管料(4/15)」の2段階構成であり、出品者は4月の2週間で連続して利益構造の見直しを迫られる。

Amazonは毎年春から夏にかけて手数料体系の見直しを実施しており、2026年も例年通り4月に大きな改定が予定されています。しかし今回の改定が例年と異なるのは、販売手数料とFBA保管料という異なるコスト項目が2週間以内に連続して改定されるという点です。

この連続改定は、準備不足のまま4月を迎えた事業者にとって、気づかないうちに利益率が数パーセントポイント低下するという事態を招きかねません。まずは改定の全体スケジュールを正確に把握することが、対策の第一歩です。

改定日改定項目変更内容(概要)主な影響対象
2026年4月1日販売手数料(紹介料)一部カテゴリで0.4%引き上げ(例:10%→10.4%)全カテゴリの出品者
2026年4月15日FBA長期保管料365日超在庫:月額20円/点のペナルティ新設FBA利用・滞留在庫保有者
参考:2025年同時期FBA配送手数料サイズ区分の再編・一部引き上げFBA利用者全般

Amazonが手数料を定期的に改定する背景には、物流コストの上昇・FC(フルフィルメントセンター)の設備投資・人件費増加などがあります。出品者としては「改定を受け入れるか否か」という選択はなく、いかに早く対策を講じて利益を守るかが唯一の選択肢となります。

🔍 このセクションの要点

2026年4月の手数料改定は4/1と4/15の2段階構成。販売手数料とFBA長期保管料という異なるコスト項目が連続して改定されるため、3月中に全商品の利益シミュレーションを完了させることが急務となる。

2. 【販売手数料】4/1改定:0.4%引き上げが利益に与える衝撃

「たった0.4%」に見える引き上げは、年間売上1億円の事業者で年間約40万円の純利益減少を意味し、特に高単価・高回転の主力商品ほど「チリツモ」で利益額を削り取る脅威となる。

2026年4月1日に実施される販売手数料(紹介料)の改定は、一部カテゴリにおいて現行の手数料率に0.4%が上乗せされる内容です。Amazonの販売手数料はカテゴリごとに異なり、一般的な商品カテゴリでは8〜15%の範囲で設定されています。

販売手数料0.4%引き上げの実額インパクト試算

「0.4%」という数字は小さく見えますが、販売規模が大きくなるほどその影響は無視できない水準となります。以下の試算で具体的なコスト増を確認してください。

💴 手数料引き上げ コスト増シミュレーション(年間)
年間売上 500万円の事業者 追加コスト +約2万円/年
年間売上 1,000万円の事業者 追加コスト +約4万円/年
年間売上 3,000万円の事業者 追加コスト +約12万円/年
年間売上 1億円の事業者 追加コスト +約40万円/年
算出根拠 年間売上 × 0.4%(手数料増加分)で試算

高単価・高回転商品における「チリツモ」の恐怖:利益率別シミュレーション

問題は売上規模だけではありません。商品単価が高い場合、たった0.4%の引き上げでも「1点あたりの利益喪失額」は数十円にのぼります。これが月間数百、数千個と売れる主力商品であれば、気づかないうちに手元に残るはずの利益がごっそりと削られることになります。

商品単価改定前利益率追加手数料(/点)改定後利益率判定
1,000円15%(150円)4円14.6%(146円)影響軽微
3,000円15%(450円)12円14.6%(438円)影響軽微
5,000円10%(500円)20円9.6%(480円)要注意(1桁台へ転落)
10,000円10%(1,000円)40円9.6%(960円)要注意(1桁台へ転落)
10,000円20%(2,000円)40円19.6%(1,960円)要注意(チリツモでの利益圧迫)
⚠️ 特に注意が必要な出品者像

利益率が10%前後で推移している商品を主力とする事業者や、価格競争が激しく「数円単位の価格転嫁」が難しいカテゴリ(日用品・家電など)は特に注意が必要です。0.4%の引き上げにより「利益率1桁台(9%台)」へ転落するケースや、高単価ゆえに1点あたりの利益喪失額が大きく、販売ボリュームによって年間数十万の利益が吹き飛ぶリスクがあるため、早急な価格・コスト構造の見直しが求められます。

🔗 参照:Amazonセラーセントラル公式:2026年販売手数料の改定(4/1〜)
🔍 このセクションの要点

販売手数料0.4%の引き上げは、年間売上1億円規模で約40万円のコスト増に相当する。特に「利益率10%前後の商品」は1桁台へ転落する財務的・心理的ダメージが大きく、高単価商品ほど金額ベースでの利益圧迫が強まるため、3月中に全商品の利益率を再計算し、価格改定の要否を判断することが不可欠だ。

3. 【FBA手数料】4/15改定:365日超の在庫ペナルティ新設という罠

365日を超えてFBC倉庫に留まる在庫に対して「月額20円/点」のペナルティが新設される。1,000点の滞留在庫を持つ事業者は、毎月2万円の追加コストが発生し続ける。

2026年4月15日に実施されるFBA手数料の改定では、Amazonのフルフィルメントセンター(FC)に365日を超えて保管されている在庫に対して、新たなペナルティ料金が課されることが発表されています。

これまでもAmazonは長期保管料として一定の費用を課していましたが、今回の改定ではそのハードルが実質的に引き下げられ、かつペナルティの単価も見直されています。滞留在庫を「そのままにしておけばいつか売れる」という発想で放置してきた事業者には、直接的かつ継続的な損益悪化をもたらすルール変更です。

新設ペナルティの詳細と従来ルールとの比較

項目改定前(〜2026/4/14)改定後(2026/4/15〜)
長期保管料の発生条件保管開始から一定期間超365日超で新ペナルティ適用
ペナルティ単価既存の長期保管料体系に準拠月額20円/点(新設)
適用タイミング月次集計月次集計(毎月15日基準)
免除条件在庫返送・廃棄により回避可在庫返送・廃棄により回避可(変更なし)

滞留在庫数別・年間追加コスト試算

📦 365日超在庫 ペナルティコスト試算(月額・年額)
滞留在庫 100点 月額 2,000円 / 年額 24,000円
滞留在庫 500点 月額 10,000円 / 年額 120,000円
滞留在庫 1,000点 月額 20,000円 / 年額 240,000円
滞留在庫 5,000点 月額 100,000円 / 年額 1,200,000円
算出根拠 月額20円/点 × 滞留点数で試算

5,000点規模の滞留在庫を抱える事業者にとって、年間120万円の追加コストは決して軽視できる金額ではありません。在庫管理を属人的に行っていたり、販売計画の精度が低かったりする場合、この改定は気づかないうちに損益計算書を侵食し続ける「静かな損失」となります。

4月15日までに確認すべき在庫チェック手順

  • 📋 セラーセントラル「在庫管理」で保管日数を確認:「管理在庫」→「在庫年齢」タブから365日超の在庫を抽出する。
  • 📋 対象SKUごとに「処理コスト vs 継続保管コスト」を比較:在庫返送(納品元への返品)・廃棄・緊急値下げセールのどれが最も損失を抑えられるかを試算する。
  • 📋 自動返送設定の活用:セラーセントラルの「自動不良在庫の撤去」設定を活用することで、ペナルティ適用前に自動的に処理することが可能。
  • 📋 廃棄申請のタイミング:廃棄費用が月額ペナルティを下回る場合は早期廃棄が合理的。単価・在庫残存月数を比較して判断する。
🔗 参照:Amazonセラーセントラル公式:2026年FBA長期在庫追加手数料の改定(4/15〜)
🔍 このセクションの要点

365日超の滞留在庫に対する月額20円/点のペナルティは、1,000点規模で年間24万円の追加コストとなる。4月15日までに在庫年齢を確認し、早期廃棄・返送・自動返送設定の活用でペナルティを回避する行動が求められる。

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4. IRUNEの視点:利益低下を防ぐ「3つの防衛戦略」

手数料改定への対応は「コストの受け入れ」ではなく「価格・構造・在庫」の3軸を同時に見直すことで、改定後も利益水準の維持を目指すことができる。

手数料の改定は不可抗力ですが、それに対してどう動くかは出品者の戦略次第です。株式会社IRUNEでは、今回の改定に対して以下の3つの防衛戦略を推奨しています。これらは単体でも効果がありますが、組み合わせて実施することで相乗的な利益防衛効果を発揮します。

1
防衛戦略①:価格改定の戦略的タイミング設計
手数料引き上げ分を価格に転嫁する際、最も重要なのは「タイミング」と「競合動向との連動」です。競合他社も同じ手数料改定を受けるため、市場全体でゆるやかな価格上昇が起きる可能性があります。そのタイミングを見極め、自社が過度な競争力低下を招かずに価格を引き上げられる局面を狙います。
✅ 3月中旬:全商品の現行利益率を再計算し、価格転嫁が必要なSKUを特定
✅ 3月下旬:競合価格をモニタリングし、改定後の適正価格帯を設定
✅ 4月1日以降:価格改定を実施し、CVRへの影響を週次でモニタリング
2
防衛戦略②:梱包サイズの再最適化によるFBA手数料削減
FBA配送手数料はサイズ・重量によって区分が決まります。現在の梱包仕様が「小型」「標準」「大型」のどの区分に該当するかを確認し、わずかな梱包変更でより低コストの区分に移行できないかを検討します。梱包の薄型化・軽量化で1区分下げられれば、1点あたり数十〜数百円の手数料削減が可能です。
✅ セラーセントラル「FBA料金計算ツール」で現在の手数料区分を確認
✅ 梱包資材の見直し(内箱・緩衝材の薄型化)で重量・サイズを最適化
✅ 重量・寸法の計測値に誤りがないか確認(誤登録による過剰手数料の防止)
3
防衛戦略③:不良在庫の早期損切りと自動返送設定の活用
4月15日のペナルティ新設を前に、365日超の滞留在庫は「廃棄コスト<ペナルティ累計コスト」の観点から早期処理を判断します。また、セラーセントラルの「自動不良在庫の撤去」機能を活用することで、将来的な長期保管リスクを自動的に回避する仕組みを構築します。
✅ 「在庫年齢レポート」で300日超のSKUを抽出・リスト化
✅ 各SKUの廃棄費用と今後のペナルティ合計を比較して早期廃棄を判断
✅ セラーセントラル「フルフィルメント設定」→「自動不良在庫撤去」を有効化

3つの防衛戦略の優先順位と実施ロードマップ

時期実施アクション優先度期待効果
今すぐ(3月中)全商品の利益シミュレーション実施最優先改定後の赤字商品を事前把握
3月下旬365日超在庫の特定・廃棄/返送判断最優先4/15ペナルティ新設前に処理完了
3月下旬〜4/1価格改定対象SKUの価格設定・競合調査改定と同時に適正価格へ移行
4月中旬まで梱包サイズ再計測・区分最適化FBA手数料の継続的な削減
4月以降・定常化自動不良在庫撤去の設定・月次利益チェック長期保管リスクの恒常的な回避
🔗 参照:Amazonセラーセントラル公式:2026年FBA配送代行手数料の改定(4/1〜)
🔎 IRUNEならこう解決する

株式会社IRUNEでは、手数料改定を見据えた全SKUの利益シミュレーション・価格改定戦略の立案・FBA手数料区分の最適化・滞留在庫の早期処理計画を一貫してサポートします。元Amazon在籍メンバー多数の知見をもとに、改定後も着実な利益水準の維持・向上を目指す運用体制の構築を支援します。

5. まとめ:正確な利益シミュレーションが2026年を生き残る鍵

手数料改定への対応の遅れは、日々の損益を静かに侵食する。今すぐ全商品の利益構造を再計算し、3月中に行動計画を確定させることが、2026年のAmazon事業の安定成長につながる。

2026年4月のAmazon手数料改定は、単なる「コスト増」以上の意味を持っています。それは、利益管理の精度が低い事業者と高い事業者の差が、改定をきっかけにより鮮明になるという競争環境の変化でもあります。

今回の改定で最も重要なのは、以下の2点を3月中に完了させることです。

  • 全商品の利益シミュレーション更新:4月1日の販売手数料引き上げと4月15日のFBAペナルティを両方反映した利益計算を実施し、赤字化リスクのある商品を特定する。
  • 365日超在庫の緊急処理:セラーセントラルの在庫年齢レポートで対象在庫を抽出し、廃棄・返送・自動返送設定のいずれかで4月15日前に処理を完了させる。

Amazonは今後も事業規模の拡大とともに、手数料体系の見直しを継続的に行うことが予想されます。そのたびに対応を後手に回すのではなく、日常的な利益モニタリング体制を構築し、改定情報を即座に利益計算に反映できる運用環境を整えることが、中長期的な競争優位につながります。

📌 2026年4月 手数料改定 最終チェックリスト
□ 全商品の利益シミュレーションを改定後の手数料率で更新済み
□ 赤字転落リスクのあるSKUを特定し、価格改定の要否を判断済み
□ 365日超の滞留在庫をリスト化し、廃棄/返送の処理計画を策定済み
□ 自動不良在庫撤去の設定を有効化済み
□ 梱包サイズ・重量の最適化余地を確認済み
□ 4月1日〜15日の対応スケジュールを社内で共有済み

🔍 このセクションの要点

手数料改定への対応は「3月中の利益シミュレーション完了」と「4月15日前の滞留在庫処理」の2点に集約される。日常的な利益モニタリング体制の整備が、今後も続く改定リスクへの最も有効な備えとなる。

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